ระบบควบคุม ของ Yamaha YZF-R15 มีดังนี้:
| รุ่นย่อย | Yamaha YZF-R15 2015 MotoGP Edition | Yamaha YZF-R15 2015 Standard | Yamaha YZF-R15 2016 Standard | Yamaha YZF-R15 2017 Standard | Yamaha YZF-R15 2018 MotoGP Edition | Yamaha YZF-R15 2018 Standard | Yamaha YZF-R15 2019 Standard |
| ระบบล๊อกรอบออกตัว | N | N | N | N | N | N | N |
| เซ็นทรัลล็อค | N | N | N | N | N | N | |
| สวิทช์ปรับไฟสูง | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
| มาตรวัดระยะทาง | |||||||
| มาตรวัดน้ำมันเชื้อเพลิง | Digital | Digital | Digital | Digital | Digital | Digital | Digital |
| หน้าจอแสดงผล | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
| มาตรวัดความเร็ว | Digital | Digital | Digital | Digital | Analog | Analog | Digital |
| มาตรวัดระยะทางที่สามารถตั้งเอง | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
| ระบบนำทางเนวิเกเตอร์ | N | N | N | N | N | N | N |
| เครื่องวัดความเร็วรอบ | Y | Y | Y | Y | Y | Y | Y |
| ระบบเปิด-ปิด เครื่องยนต์ด้วยกุญแจอัจฉริยะ | N | N | N | N | N | N | N |
